科研动态

科研人员完成白肉灵芝全基因组测序

来源: 时间:2021-11-12

  白肉灵芝作为我国具有鲜明地域特色的野生资源,首次被668866路线微生物研究所科研人员采集并进行命名,目前已成为科技扶贫的典型案例和带动一方经济发展的重要资源,在中国西南地区广泛种植。白肉灵芝是在中国发现的灵芝科一新种,具有多种药理活性但由于缺乏参考基因组而阻碍了系统的遗传研究。

  近日,省科学院微生物研究所吴清平院士团队完成了第一个白肉灵芝全基因组测序科研人员从一个单核菌株(DH-8)中提取了高质量的DNA,并基于Illumina和Nanopore平台组装完成第一个白肉灵芝全基因组。组装的基因组大小为50.05Mb,N50为3.06Mb、预测到78,206条编码序列和13,390个基因。使用 Benchmarking Universal Single-Copy OrthologsBUSCO工具评估基因组完整性,该工具鉴定了280个真菌BUSCO基因中的96.55%。此外,分析了白肉灵芝和灵芝之间次级代谢产物(萜类化合物)的功能基因的差异。

  研究发现,与灵芝相比,白肉灵芝具有更多与萜类化合物合成相关的基因,这可能是它们表现出不同生物活性的原因之一。据该项目负责人胡惠萍正高级工程师先容,这是世界上首次对白肉灵芝的基因组进行组装和注释。她认为白肉灵芝基因组是目前组装质量最好的灵芝属物种,该成果对丰富白肉灵芝生物和遗传研究的基础具有引导作用,为今后特定物种的高原适应性深层研究奠定基础。

  相关研究成果发表在期刊G3-Genes Genomes Genetics

  相关论文:Liu, Y., Huang, L., Hu, H., Cai, M., Liang, X., Li, X., ... & Wu, Q. (2021). Whole-genome assembly of Ganoderma leucocontextum (Ganodermataceae, Fungi) discovered from the Tibetan Plateau of China. G3 Genes| Genomes| Genetics.

  文链接:https://doi.org/10.1093/g3journal/jkab337

 吴清平院士(左二)团队与白肉灵芝推广人员交流

在韶关产业园种植的白肉灵芝

(省科学院微生物研究所/供稿)

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